Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DSC2Q02487 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms