Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SKP1P63208 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms