Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJA9P57773 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA9P57773 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms