Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPD52P55327 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPD52P55327 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TPD52P55327 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TPD52P55327 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms