Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPAP53621 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COPAP53621 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPAP53621 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms