Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSK3BP49841 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GSK3BP49841 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms