Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GNPDA1P46926 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms