Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACADSBP45954 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms