Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms