Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGAEP38570 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms