Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPN7P35236 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms