Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPL9P32969 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPL9P32969 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL9P32969 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL9P32969 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPL9P32969 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL9P32969 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms