Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HOXC13P31276 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC13P31276 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms