Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRB3P28472 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms