Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLD1P28340 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLD1P28340 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLD1P28340 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms