Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBRP28336 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms