Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRDP23468 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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