Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2CP19387 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2CP19387 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms