Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CKMT2P17540 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CKMT2P17540 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKMT2P17540 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CKMT2P17540 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms