Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODC1P11926 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODC1P11926 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODC1P11926 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODC1P11926 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms