Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHGAP10645 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHGAP10645 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms