Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOA4P06727 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms