Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LDLRP01130 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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