Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTCP00480 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OTCP00480 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTCP00480 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTCP00480 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTCP00480 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms