Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPLO60437 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPLO60437 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPLO60437 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPLO60437 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms