Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HOXA3O43365 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms