Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBDO15205 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBDO15205 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBDO15205 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBDO15205 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBDO15205 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms