Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYNJ2O15056 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms