Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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