Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms