Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AGAP5A6NIR3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms