Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL33A6NCF5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms