Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF22A3QJZ6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF22A3QJZ6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms