Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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