Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
XCL2Q9UBD3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms