Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IGSF9Q9P2J2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms