Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP35Q9P2H5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP35Q9P2H5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms