Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP36Q9P275 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms