Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KCMF1Q9P0J7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms