Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSD3Q9NYI0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms