Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THUMPD1Q9NXG2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms