Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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