Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RHBDL2Q9NX52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms