Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf109Q9NX04 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf109Q9NX04 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms