Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYLDQ9NQC7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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