Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHST11Q9NPF2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHST11Q9NPF2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms