Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPJQ9HC77 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPJQ9HC77 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms