Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC3GQ9HC16 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms