Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LIN28AQ9H9Z2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms