Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms